การศึกษานี้มีวัตถุประสงค์เพื่อหาเครื่องหมายโมเลกุลที่สามารถบอกความแตกต่างระหว่างข้าวพันธุ์ขาวดอกมะลิ 105 ซึ่งเป็นข้าวหอมมะลิไทยที่เป็นที่นิยมอย่างสูงในตลาดต่างประเทศ กับพันธุ์ปทุมธานี 1 ซึ่งเป็นข้าวหอมที่มักถูกนำมาปลอมปนเพื่อการส่งออก ขั้นตอนการศึกษาประกอบด้วยการสกัดดีเอ็นเอ จากต้นกล้าข้าว 3 พันธุ์ คือ ขาวดอกมะลิ 105 ปทุมธานี 1 และ กข 15 นำดีเอ็นเอที่ได้ไปเป็นต้นแบบใน ปฏิกิริยาพีซีอาร์ โดยใช้ SSR primers จำนวน 21 คู่ ได้แก่ RM1, RM3, RM5, RM6, RM7, RM11,RM13, RM19, RM20, RM25, RM44, RM53 RM164, RM170, RM189, RM206, RM209, RM224,RM231, RM261, และ RM337 ตรวจสอบผลการทำพีซีอาร์ด้วยอิเล็กโทรโฟริซิสในวุ้นอะกาโรสเข้มข้น5% พบว่ามี SSR primers จำนวน 3 คู่ ที่ให้แถบดีเอ็นเอที่บอกความแตกต่างระหว่างสายพันธุ์ได้ ได้แก่RM7, RM19, RM206